三甲基硅咪唑是硅烷化羟基的最强的硅烷化试剂；能够快速、平顺地与羟基和羧基发生反应。不与胺或酰胺发生反应，所以可以用于制备既含有羟基又含有氨基的化合物的多重衍生物。在存在少量水的情况下可用于硅烷化糖；当需要将糖作为糖浆剂来分析的时候是硅烷化糖的理想选择。能够衍生不被阻碍和被严重阻碍的大多数的甾类羟基。

三甲基硅咪唑在有机化学中是一种常用的硅烷化试剂，其不与胺或酰胺发生反应，所以可以用于制备既含有羟基又含有氨基的化合物的多重衍生物。此外，该化合物还可以和三氯氧膦进行反应，将咪唑基团转移至膦中心生成三咪唑氧膦化合物。该化合物在医药生产领域业有广泛应用，例如三甲基硅咪唑可用作抗菌素的合成中间体。

往一个干燥的圆底烧瓶（50毫升）中加入相应的咪唑（1毫摩尔）、硫酸壳聚糖纳米杂化物（0.05克）和六甲基二硅氮烷（10毫升），然后将所得的反应混合物加热至90℃，并在这个温度下搅拌反应7分钟，直到达到透明液体。反应结束后直接将反应混合物过滤除去催化剂，所得的滤液在真空中进行浓缩蒸发滤液，即可得到目标产品三甲基硅咪唑。

用作抗菌素中间体、特强的硅烷化剂高效硅烷化试剂，特别适合用于醇、酰基咪唑类的合成，在氨基存在的条件下保护羟基基团。抗菌素中间体。用于合成各种酰基咪唑的重要中间体，也是合成吡藜酰胺的重要中间体；在胺功能化条件下，保护羟基的硅烷化试剂；强有力的硅烷化试剂、特别针对醇类；酰基咪唑啉的合成甲硅烷基化试剂，在氨基存在的条件下保护羟基基团。抗菌素中间体。