2-氯-6-三氟甲基吡啶是合成杀虫剂的关键中间体，杀虫剂是由美国一家公司在90年代开发成功的用于防治棉花、大豆、油菜等大田作物害虫的产品。具有药效强、亩用量少、低毒性、低残留特点，效果显著，是国外发达国家已上升为杀虫剂的骨干产品。
2-氯-6-三氟甲基吡啶不但作为新型的农药中间体，在有机合成和染料、医药领域也用途广泛，近年来，人们发现由于杂环上引入三氟甲基可提高化合物的亲脂性，从而提高对生物体膜和组织的渗透性及同生物体反应时的电子吸引性，增强化合物的生理活性。