DNA聚合酶是细胞复制DNA的重要作用酶。DNA聚合酶，以DNA为复制模板，将DNA由 5’端点开始复制到3’端的酶。DNA聚合酶的主要活性是催化DNA的合成(在具备模板、引物、 dNTP等的情况下)及其相辅的活性。

TaqDNA聚合酶有一个特性除了合成速度快、出错率高以外，还会使合成的产物“末端带有一个A碱基”，TA克隆即是利用Taq聚合酶此特性，Taq的PCR产物在3'末端会多出一个A，此时只须有一个与其互补的T表现在质体上，即能彼此靠近，借由接合酶连接起来。透过此方式，可省去限制酶剪切的时间，直接利用PCR产物与质体彼此有互补两端的特性，可快速黏合起来。

TaqDNA聚合酶常用于放大短DNA片段的聚合酶链式反应中（PCR）。水生栖热菌生活在温泉与深海热泉中，从其中分离的Taq酶可承受PCR中所需要的高温。因此TaqDNA聚合酶取代了原先用于PCR中的大肠杆菌DNA聚合酶。

DNA聚合酶Ⅰ可以沿着DNA模板，顺着RNA成分的引物延长新合成的DNA链条。3`-5`外切酶可以校正未成功配对的脱氧核苷酸。随着DNA的不断复制，下游的RNA引物逐渐接近聚合活性位点，到最后，RNA引物会脱离DNA模板，形成flapDNA。在热涨落的作用下，flapDNA会从聚合酶区脱离；同时，5`核酸酶区在热运动的作用下偏离平衡位置，拉伸linker,逐渐移动靠近聚合酶区，最终5`核酸酶的活性位点会在聚合酶的活性位点附近将flapDNA捕获并切除RNA引物 ，留下一个小缺口，由DNA连接酶来修补。