4-氨基-3-碘吡啶主要用作有机合成和医药化学的中间体，可用于药物分子和生物活性分子的合成。在有机合成转化中，4-氨基-3-碘吡啶中的碘单元可以在金属钯的催化作用下进行相应的Suzuki偶联反应在吡啶的3号位连接上一个芳基或者也可以通过Sonogashira反应和端炔进行偶联。向4-氨基吡啶（18.8毫克，0.2毫摩尔）、碘（27.9毫克，0.11毫摩尔）和4-碘苯磺酸钾（19.5毫克，0.055毫摩尔）在乙腈（0.5毫升）中的混合物里慢慢地添加H2SO4水溶液（5%，0.5毫升），并将得到的反应混合物在65度下搅拌反应12小时，反应体系通过TLC点板和GC-MS监测反应进度，反应结束后向反应混合物中加入5%的Na2SO3水溶液（0.5mL）和水（5mL），然后摇动反应混合物5分钟，然后过滤沉淀物并用水清洗，干燥沉淀物即可得到目标产物分子4-氨基-3-碘吡啶。