白色结晶粉末。从水溶液结晶时带有五分子结晶水。密度1.465。熔点80℃。缓缓加热至100℃时失去结晶水。由棉子饼磨粉水解或甜菜糖蜜制得的一种三糖。由右旋半乳糖、右旋葡萄糖和左旋果糖各一分子组成。无水物熔点118~119℃。溶于水。极微溶于乙醇。有右旋光性。供医药、微生物培养基等用。

棉子糖是一种功能性低聚糖，它不被人体肠胃消化液所吸收分解，能通过胃、小肠直接进入大肠肠道被微生物发酵利用，其代谢方式通过胃、小肠直接进入大肠肠道被微生物发酵利用，其代谢方式类似膳食纤维。据分析，棉子糖的能量值为6kJ/g。
棉子糖是人体肠道中双歧杆菌、嗜酸乳酸杆菌等有益菌极好的营养源和有效的增殖因子，棉籽糖有整肠和改善排便的功能，它能改善人体的消化功能，促进人体对钙的吸收。从而增强人体免疫力。对预防疾病和抗衰老有明显效果。棉子糖可作为人体和动物活器官移植用保护输送液的主要成分及延长活菌体在常温下存活期的增效剂。